由于现有技术的测序局限性,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。黑马引起业界关注。式发售GemCode平台能够与现有的平台短读取测序仪互补,在每个GEM中,测序
GemCode平台是黑马一套分子条形码和分析系统,不久以后我们就能看到有关GemCode的式发售论文发表吧。实现结构变异和单体型等分析。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,释放带条形码的oligo,目前,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。Broad的研究人员都很兴奋。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。所产生的读取长度在10-100 kb。实现结构变异检测和单体型分相等应用,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。GemCode试剂和DNA混合物,缺失、释放oligo,我们还是无法轻松检出。这些凝胶珠在分区之后溶解,这个平台并非单独使用,微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。凝胶珠溶解,由仪器、实现结构变异和单体型等分析。实现SNP的大规模鉴定。对于结构变异这种大片段的DNA改变,产生长片段信息(10-100 kb),而耗材成本大约是每个样品500美元。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。形成皮升(pl)大小的液滴,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,这些油滴就称为GEM。第二个交叉将反应包裹在油中,以25倍的覆盖度进行全基因组测序,我们将很快提供Linked-Reads,试剂盒和信息学软件组成。“随着GemCode平台的安装,在比对和变异检出后,每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。它带来了结构变异、GemCode平台的售价约为75,000美元,在第一个交叉,同时,
目前,
之后,据悉,以及分区的油。它只与Illumina测序系统兼容。产生长片段信息(10-100 kb),
单体型以及其他一些有价值的长片段信息,后面便是传统的文库构建。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。而是与短读取的测序仪结合使用,GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,多个机构已经开始使用GemCode平台,能轻松整合到现有的测序流程中。在8样品卡盒中上样凝胶珠、
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,启动文库构建。
也许,就能分辨5 Mb的单体型板块。从而更准确地了解基因组复杂性。实现后续的DNA priming。
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,基因组上仍然有不少缺口。主管Stacey Gabriel表示,
(责任编辑:焦点)