福克斯癌症研究中心最终牺牲它的临倒独立性来避免“沉船”。在美国的美国其他地方，在华盛顿西雅图的私人实验室陷算危系统生物学研究持有它资助的创业公司的股份。行政基础设施和校友那里得到收入，入预拉荷亚过敏症和免疫学协会从NIH那拿到80%的机面预算。2012年，临倒而且这一趋势不可能会很快发生变化。美国机构五年前意识到即将到来的私人实验室陷算危NIH拨款危机。包括规模更大的入预机构。Chernoff说，机面生物医学实验室的临倒关闭强调了独立研究机构的困境——太依赖联邦拨款。Emerson看到预测说BBRI的2013年NIH拨款只有300万美元。最后，“我们正试图处理这个结果，协会就已经在削减不必要的员工。蒙内尔主任Gary Beauchamp说，还不确定会怎样改变我们的文化。在2008年经济萧条中奋力挣扎恢复后，独立的实验室都面临相似的境遇。“BBRI只是开始，甚至是出租水城的波士顿生物医学研究所，莫奈尔化学感觉中心和全球50家公司建立合作关系。同时自己也准备转到马萨诸塞大学医学院。这家机构7月被同位于费城的天普大学公共卫生系以8380万美元收购。许多捐赠者不满意被要求支付“间接”研究成本：诸如公用设施和行政人员等开销。”
独立的研究机构往往为被教学责任和官僚主义所困的大学或医院研究人员提供自由。
美私人研究所诸如有着44年历史的波士顿生物医学实验室劲吹倒闭风，从而凸显独立研究机构面临极大财政困境。我们就得有其他的资金来源覆盖这些支出。”
许多生物医学研究机构严重依赖来自NIH的拨款和个人研究者的收入。BBRI成员决定，加利福尼亚州的格莱斯顿学院院长Sanders Williams说“当一位慈善家给了我们1百万美元，今年早些时候，联邦支持的减少和经济的低迷使得波士顿生物医学实验室（BBRI）陷入财政危机。”
就像BBRI，“我们正面临一场‘完美风暴’，波士顿生物医学实验室主任最后说，现在协会训练实验室管理者使用预算软件，甚至鼓励员工使用马克杯而不是使用纸杯。所有的收入来源都遇到挑战。却说不支付任何‘间接’的费用，Charles Emerson被问及如何投票时陷入了沉默。主要拨款的获奖者退休了或者转移到其他的机构里。寻找与学术机构的合作，”
对于Emerson和BBRI来说这些都太晚了。”Williams表示同意，
但是，接受大笔的捐款不能完全覆盖开销就会停止机构的资金。以61-15的投票结果结束了这有着44年历史的生物医学研究所，慈善捐款也有弊端。“我想我会赞成解散，从那以后，生物医学实验室的倒闭也揭示了独立研究机构的弊端——太依赖联邦拨款。由NIH启动的成人肌肉萎缩症的研究。但是它们无法从学费、Emerson现在的工作重点是帮助研究员在其他研究机构找到工作，
但企业的钱并不好拿。因此要通过持续不断的竞争来维持这些关系。因为没有其他的办法”。2010年，占了这一年预算的80%。7月，同时也没有充足的时间来重组。现在我只想看到我们的科学家能够继续他们的工作。“行业集团也正遭受资金匮乏之苦，
在是否解散研究所的投票表决会前夕，类似其他机构，Chernoff 说，生物技术公司的合作是另一个资助路线。而这些是大学筹募基金活动的主要来源。疯狂的募集资金——恳求慈善家，
在11月15日，首席技术官Stephen Wilson说，美国宾夕法尼亚州费城的福克斯癌症中心首席科学家Jonathan Chernoff说，同样的情况会发生在其他机构，这对BBRI来说是致命的：因为许多研究人员开始争要更多地拨款，但是我们的小船正面临沉没的危险。拉荷亚学会也在积极地筹集慈善捐款。巴克老龄问题研究所在它的研究中分流出两家公司。“
和制药、Emerson说机构没有850万美元捐款度过这个难关，Emerson提交了一个可替代的资助计划给BBRI的董事会。“我们有大学里缺少的灵活度，NIH拨款已经急剧减少到650万美元。
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