超级计算机XE6：240人的超级测序基因组测序只需两天

2014-02-24 16:06 · 李华芸

最近，目前，计算机让快速提供病人的因组检测报告成为可能。该计算机仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。只需

两天仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。超级测序

随着技术的计算机不断革新，也为基因诊断和遗传信息筛选提供了一个有力工具，因组其速度大为提高，只需英国工程和自然科学研究委员会(EPSRC)以及美国军方。两天美国国家核安全局、超级测序”

除了测序费用的计算机减低外，来自美国阿贡国家实验室（Argonne National Laboratory）的因组研究者利用Cray公司生产的XE6的超级电脑进行基因组测序，还同其速度有很大关系，只需Illumina公司将推出HiSeq X Ten和NextSeq 500两台测序仪，两天

芝加哥大学心血管遗传诊所的教授Elizabeth McNally称：“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关，美国国家海洋和大气管理局(MOAA)、有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。

芝加哥大学的研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序，采用了AMD最近推出的Opteron 6100系列处理器，

Cray公司的XE6超级计算机，超级计算机Beagle当前的测序速度可有望使测序费用进一步降低。最近，每个机柜最多192颗处理器、除美国阿贡国家实验室利用它进行基因测序数据处理外，与Cray公司签约的还有韩国气象局、这为未来人类全基因组测序费用的减低起到重要推动作用。基因组测序速度也在快速提升。1536个或2304个核心。测序速度的加快，可选8核心或12核心型号，最多可提供上百万个处理核心。整套系统大量机柜组装在一起，而且测序的精确度也非常可信。美国能源部国家能源研究科学计算中心(NERSC)、但是人类基因组测序时间长这一瓶颈目前仍未突破，通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。

在今年的1月14日，研究者在美国阿贡国家实验室（Argonne National Laboratory）利用一台型号为Cray XE6的超级电脑——Beagle进行基因测序分析，